Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms