Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 RPO41YFL036W 4056 nt2.56□□□□□ -2
YMR226CQ05016 YIL080WYIL080W 4722 nt2.56□□□□□ -2
YMR226CQ05016 NAB3YPL190C 2409 nt2.56□□□□□ -2
YMR226CQ05016 TRM1YDR120C 1713 nt2.55□□□□□ -2
YMR226CQ05016 SAD1YFR005C 1347 nt2.55□□□□□ -2
YMR226CQ05016 MST27YGL051W 705 nt2.55□□□□□ -2
YMR226CQ05016 DCG1YIR030C 735 nt2.55□□□□□ -2
YMR226CQ05016 SPH1YLR313C 1593 nt2.55□□□□□ -2
YMR226CQ05016 MRPL27YBR282W 441 nt2.55□□□□□ -2
YMR226CQ05016 YOR296WYOR296W 3870 nt2.55□□□□□ -2
YMR226CQ05016 SWR1YDR334W 4545 nt2.54□□□□□ -2
YMR226CQ05016 YDR209CYDR209C 414 nt2.54□□□□□ -2
YMR226CQ05016 YDR535CYDR535C 501 nt2.54□□□□□ -2
YMR226CQ05016 HMF1YER057C 390 nt2.54□□□□□ -2
YMR226CQ05016 ERP6YGL002W 651 nt2.54□□□□□ -2
YMR226CQ05016 MRPL9YGR220C 810 nt2.54□□□□□ -2
YMR226CQ05016 MDJ2YNL328C 441 nt2.54□□□□□ -2
YMR226CQ05016 TRM112YNR046W 408 nt2.54□□□□□ -2
YMR226CQ05016 HSP10YOR020C 321 nt2.54□□□□□ -2
YMR226CQ05016 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.54□□□□□ -2
YMR226CQ05016 POL30YBR088C 777 nt2.54□□□□□ -2
YMR226CQ05016 CWH41YGL027C 2502 nt2.54□□□□□ -2
YMR226CQ05016 PKP2YGL059W 1476 nt2.53□□□□□ -2
YMR226CQ05016 SEC26YDR238C 2922 nt2.53□□□□□ -2
YMR226CQ05016 SAS4YDR181C 1446 nt2.53□□□□□ -2
YMR226CQ05016 AVT2YEL064C 1443 nt2.53□□□□□ -2
YMR226CQ05016 ENP2YGR145W 2124 nt2.53□□□□□ -2
YMR226CQ05016 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.53□□□□□ -2
YMR226CQ05016 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.53□□□□□ -2
YMR226CQ05016 YER147C-AYER147C-A 411 nt2.53□□□□□ -2
YMR226CQ05016 YLR339CYLR339C 552 nt2.53□□□□□ -2
YMR226CQ05016 RIM9YMR063W 720 nt2.53□□□□□ -2
YMR226CQ05016 ATG34YOL083W 1239 nt2.53□□□□□ -2
YMR226CQ05016 CDC55YGL190C 1581 nt2.53□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 IRA2YOL081W 9240 nt2.53□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 RNH202YDR279W 1053 nt2.52□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YGR114CYGR114C 390 nt2.52□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 MIC27YNL100W 705 nt2.52□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YCL019WYCL019W 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 MPS1YDL028C 2295 nt2.52□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 CET1YPL228W 1650 nt2.51□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 ARP8YOR141C 2646 nt2.51□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 snR57snR57 88 nt2.51□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 snR63snR63 255 nt2.51□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 LSM8YJR022W 330 nt2.51□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 DID4YKL002W 699 nt2.51□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YML037CYML037C 1023 nt2.51□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YBL096CYBL096C 309 nt2.51□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 TIM12YBR091C 330 nt2.51□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 GIN4YDR507C 3429 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 MSH4YFL003C 2637 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 ISW1YBR245C 3390 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 SPF1YEL031W 3648 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YPL216WYPL216W 3309 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YGL101WYGL101W 648 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 CIR1YGR207C 786 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 SOL3YHR163W 750 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YHR213WYHR213W 597 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 SIC1YLR079W 855 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 MST28YAR033W 705 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YAR062WYAR062W 597 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 PSY3YLR376C 729 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 SUB1YMR039C 879 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YMR087WYMR087W 855 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 KTI11YBL071W-A 249 nt2.5□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 VHR1YIL056W 1923 nt2.49□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 RRG1YDR065W 1098 nt2.49□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 NSE3YDR288W 912 nt2.49□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YGL159WYGL159W 1113 nt2.49□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 SRN2YLR119W 642 nt2.49□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YLR400WYLR400W 474 nt2.49□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 IAH1YOR126C 717 nt2.49□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 PIS1YPR113W 663 nt2.49□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 MLH1YMR167W 2310 nt2.49□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 SLI1YGR212W 1407 nt2.49□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YDR239CYDR239C 2364 nt2.49□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YNL011CYNL011C 1335 nt2.48□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 PAF1YBR279W 1338 nt2.48□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 SSN2YDR443C 4263 nt2.48□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 TOP2YNL088W 4287 nt2.48□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 RLI1YDR091C 1827 nt2.48□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 HMO1YDR174W 741 nt2.48□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YDR222WYDR222W 1248 nt2.48□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YGL138CYGL138C 1038 nt2.48□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 MCR1YKL150W 909 nt2.48□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.48□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.48□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 BOI1YBL085W 2943 nt2.48□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 FIR1YER032W 2631 nt2.47□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 STN1YDR082W 1485 nt2.47□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 YPL150WYPL150W 2706 nt2.47□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 NHP10YDL002C 612 nt2.47□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 TSC13YDL015C 933 nt2.47□□□□□ -2.01
YMR226CQ05016 ARI1YGL157W 1044 nt2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32 ms