Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms