Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms