Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms