Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms