Protein–RNA interactions for Protein: P63128

ERVK-9, Endogenous retrovirus group K member 9 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-9P63128 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-9P63128 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-9P63128 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-9P63128 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-9P63128 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-9P63128 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms