Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP6P59044 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NLRP6P59044 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP6P59044 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms