Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PCBP4P57723 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms