Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF3P57682 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF3P57682 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF3P57682 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF3P57682 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms