Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRLP54845 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRLP54845 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NRLP54845 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NRLP54845 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NRLP54845 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NRLP54845 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NRLP54845 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRLP54845 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRLP54845 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRLP54845 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRLP54845 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRLP54845 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRLP54845 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRLP54845 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRLP54845 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRLP54845 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRLP54845 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRLP54845 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRLP54845 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRLP54845 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRLP54845 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRLP54845 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRLP54845 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRLP54845 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRLP54845 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRLP54845 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms