Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YARSP54577 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YARSP54577 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YARSP54577 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YARSP54577 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YARSP54577 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YARSP54577 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YARSP54577 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YARSP54577 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YARSP54577 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YARSP54577 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YARSP54577 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YARSP54577 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms