Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YJR027WYJR027W 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YML039WYML039W 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YML045WYML045W 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YMR050CYMR050C 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SWC4YGR002C 1431 nt2.59□□□□□ -1.99
UFD1P53044 DSE1YER124C 1722 nt2.59□□□□□ -1.99
UFD1P53044 MDV1YJL112W 2145 nt2.59□□□□□ -1.99
UFD1P53044 ATP25YMR098C 1839 nt2.59□□□□□ -1.99
UFD1P53044 ESL1YIL151C 3357 nt2.59□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SHR3YDL212W 633 nt2.59□□□□□ -1.99
UFD1P53044 GRX2YDR513W 432 nt2.59□□□□□ -1.99
UFD1P53044 RGI2YIL057C 495 nt2.59□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SED5YLR026C 1023 nt2.59□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SAM37YMR060C 984 nt2.59□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YBR013CYBR013C 390 nt2.59□□□□□ -1.99
UFD1P53044 ERV15YBR210W 429 nt2.59□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YLR278CYLR278C 4026 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 ATG13YPR185W 2217 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 PRP8YHR165C 7242 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 NMD2YHR077C 3270 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 PSP1YDR505C 2526 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 RPF2YKR081C 1035 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 APC9YLR102C 798 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 REC102YLR329W 795 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 ECM13YBL043W 774 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 YBL062WYBL062W 381 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 CEP3YMR168C 1827 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 ARP9YMR033W 1404 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 SMC2YFR031C 3513 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 PHO81YGR233C 3537 nt2.58□□□□□ -2
UFD1P53044 TFC4YGR047C 3078 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 ERG11YHR007C 1593 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 SIN3YOL004W 4611 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 VBA4YDR119W 2307 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 snR78snR78 87 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 NKP1YDR383C 717 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 PSF2YJL072C 642 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 GLG2YJL137C 1143 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 IME1YJR094C 1083 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 VPS25YJR102C 609 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 YMR087WYMR087W 855 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 SSN8YNL025C 972 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 HHF1YBR009C 312 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 GRX7YBR014C 612 nt2.57□□□□□ -2
UFD1P53044 HEH2YDR458C 1992 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 MEI4YER044C-A 1227 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 YGL204CYGL204C 306 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 MMF1YIL051C 438 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 YBL028CYBL028C 321 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 YMR099CYMR099C 894 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 snR11snR11 258 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 LCL1YPL056C 306 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 BI3Q0115 1554 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 AI4Q0065 1671 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 FAA2YER015W 2235 nt2.56□□□□□ -2
UFD1P53044 HTA1YDR225W 399 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 PIB1YDR313C 861 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 SMT3YDR510W 306 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 YEL075CYEL075C 369 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 LSM4YER112W 564 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 PEX14YGL153W 1026 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 YHL005CYHL005C 393 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 PIR1YKL164C 1026 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 YLR297WYLR297W 390 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 YLR416CYLR416C 399 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 RPL6AYML073C 531 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 HHF2YNL030W 312 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 ATP11YNL315C 957 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 TPK2YPL203W 1143 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 PBP2YBR233W 1242 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 CYR1YJL005W 6081 nt2.55□□□□□ -2
UFD1P53044 NDC80YIL144W 2076 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 HRD1YOL013C 1656 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 VPS30YPL120W 1674 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 MDM10YAL010C 1482 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 ITT1YML068W 1395 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 RIM1YCR028C-A 408 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 UBC9YDL064W 474 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 ECM11YDR446W 909 nt2.54□□□□□ -2
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