Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2A2P52657 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms