Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms