Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPFP49454 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPFP49454 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPFP49454 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPFP49454 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPFP49454 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPFP49454 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPFP49454 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPFP49454 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPFP49454 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPFP49454 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPFP49454 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPFP49454 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPFP49454 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPFP49454 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPFP49454 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPFP49454 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPFP49454 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPFP49454 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPFP49454 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPFP49454 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPFP49454 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPFP49454 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPFP49454 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPFP49454 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CENPFP49454 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPFP49454 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPFP49454 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPFP49454 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPFP49454 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPFP49454 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPFP49454 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPFP49454 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPFP49454 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPFP49454 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPFP49454 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPFP49454 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms