Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms