Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX1P48742 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX1P48742 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX1P48742 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX1P48742 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX1P48742 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX1P48742 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX1P48742 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX1P48742 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX1P48742 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX1P48742 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX1P48742 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX1P48742 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX1P48742 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX1P48742 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX1P48742 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX1P48742 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX1P48742 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX1P48742 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX1P48742 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX1P48742 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX1P48742 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX1P48742 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX1P48742 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX1P48742 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms