Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITPNBP48739 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms