Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms