Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA2P47869 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA2P47869 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms