Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPZBP47756 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms