Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX2P40425 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX2P40425 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX2P40425 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX2P40425 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX2P40425 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX2P40425 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX2P40425 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX2P40425 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX2P40425 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX2P40425 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX2P40425 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX2P40425 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms