Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms