Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT9P35527 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT9P35527 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT9P35527 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT9P35527 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT9P35527 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT9P35527 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT9P35527 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT9P35527 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT9P35527 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT9P35527 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT9P35527 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT9P35527 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT9P35527 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT9P35527 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT9P35527 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT9P35527 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT9P35527 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT9P35527 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT9P35527 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT9P35527 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT9P35527 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT9P35527 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT9P35527 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT9P35527 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT9P35527 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT9P35527 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT9P35527 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT9P35527 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT9P35527 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms