Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms