Protein–RNA interactions for Protein: P35219

CA8, Carbonic anhydrase-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA8P35219 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA8P35219 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA8P35219 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA8P35219 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA8P35219 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CA8P35219 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA8P35219 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA8P35219 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CA8P35219 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA8P35219 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA8P35219 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA8P35219 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA8P35219 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CA8P35219 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CA8P35219 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CA8P35219 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA8P35219 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA8P35219 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA8P35219 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA8P35219 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA8P35219 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA8P35219 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA8P35219 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA8P35219 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA8P35219 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA8P35219 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA8P35219 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA8P35219 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA8P35219 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA8P35219 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA8P35219 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms