Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL9P32969 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL9P32969 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL9P32969 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL9P32969 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL9P32969 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL9P32969 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL9P32969 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL9P32969 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL9P32969 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL9P32969 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL9P32969 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL9P32969 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL9P32969 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL9P32969 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL9P32969 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL9P32969 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL9P32969 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL9P32969 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL9P32969 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL9P32969 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL9P32969 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL9P32969 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL9P32969 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL9P32969 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPL9P32969 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPL9P32969 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL9P32969 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL9P32969 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL9P32969 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL9P32969 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL9P32969 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL9P32969 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL9P32969 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL9P32969 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms