Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms