Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO2P25791 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO2P25791 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO2P25791 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO2P25791 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO2P25791 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO2P25791 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO2P25791 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO2P25791 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO2P25791 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO2P25791 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO2P25791 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO2P25791 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO2P25791 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO2P25791 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO2P25791 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO2P25791 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO2P25791 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO2P25791 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO2P25791 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO2P25791 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO2P25791 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO2P25791 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO2P25791 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO2P25791 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO2P25791 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO2P25791 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO2P25791 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO2P25791 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO2P25791 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO2P25791 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO2P25791 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO2P25791 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO2P25791 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO2P25791 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO2P25791 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms