Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms