Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB1P20700 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms