Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XBP1P17861 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XBP1P17861 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XBP1P17861 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XBP1P17861 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XBP1P17861 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XBP1P17861 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XBP1P17861 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
XBP1P17861 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XBP1P17861 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XBP1P17861 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
XBP1P17861 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XBP1P17861 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XBP1P17861 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XBP1P17861 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XBP1P17861 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XBP1P17861 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XBP1P17861 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XBP1P17861 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XBP1P17861 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XBP1P17861 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
XBP1P17861 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XBP1P17861 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XBP1P17861 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms