Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms