Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms