Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms