Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms