Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms