Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms