Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP3P08254 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP3P08254 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP3P08254 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP3P08254 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP3P08254 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP3P08254 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP3P08254 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP3P08254 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP3P08254 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP3P08254 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP3P08254 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP3P08254 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP3P08254 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP3P08254 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP3P08254 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP3P08254 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP3P08254 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP3P08254 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP3P08254 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP3P08254 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP3P08254 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP3P08254 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP3P08254 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP3P08254 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP3P08254 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP3P08254 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP3P08254 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP3P08254 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP3P08254 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP3P08254 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP3P08254 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP3P08254 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP3P08254 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP3P08254 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP3P08254 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP3P08254 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP3P08254 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP3P08254 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP3P08254 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP3P08254 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP3P08254 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP3P08254 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP3P08254 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP3P08254 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP3P08254 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP3P08254 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP3P08254 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP3P08254 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP3P08254 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP3P08254 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP3P08254 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP3P08254 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms