Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms