Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms