Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms