Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms