Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYF2O95926 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYF2O95926 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYF2O95926 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYF2O95926 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYF2O95926 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYF2O95926 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYF2O95926 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYF2O95926 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYF2O95926 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYF2O95926 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYF2O95926 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYF2O95926 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYF2O95926 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYF2O95926 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYF2O95926 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYF2O95926 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYF2O95926 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYF2O95926 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYF2O95926 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYF2O95926 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms