Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX58O95786 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX58O95786 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX58O95786 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX58O95786 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX58O95786 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX58O95786 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX58O95786 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX58O95786 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX58O95786 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX58O95786 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX58O95786 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX58O95786 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX58O95786 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX58O95786 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX58O95786 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX58O95786 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX58O95786 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX58O95786 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX58O95786 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX58O95786 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX58O95786 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX58O95786 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX58O95786 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX58O95786 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX58O95786 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX58O95786 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX58O95786 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX58O95786 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX58O95786 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX58O95786 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX58O95786 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX58O95786 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX58O95786 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX58O95786 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX58O95786 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX58O95786 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX58O95786 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX58O95786 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX58O95786 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX58O95786 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX58O95786 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX58O95786 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX58O95786 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX58O95786 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX58O95786 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX58O95786 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX58O95786 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX58O95786 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX58O95786 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX58O95786 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX58O95786 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX58O95786 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX58O95786 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX58O95786 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX58O95786 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX58O95786 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX58O95786 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX58O95786 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX58O95786 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX58O95786 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX58O95786 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX58O95786 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX58O95786 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX58O95786 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX58O95786 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX58O95786 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX58O95786 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX58O95786 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX58O95786 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX58O95786 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX58O95786 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX58O95786 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX58O95786 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX58O95786 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX58O95786 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms