Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP3LO60238 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms