Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms