Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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