Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERI3O43414 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERI3O43414 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERI3O43414 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERI3O43414 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERI3O43414 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERI3O43414 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERI3O43414 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERI3O43414 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERI3O43414 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERI3O43414 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERI3O43414 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERI3O43414 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERI3O43414 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERI3O43414 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERI3O43414 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ERI3O43414 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERI3O43414 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERI3O43414 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERI3O43414 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERI3O43414 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERI3O43414 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERI3O43414 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERI3O43414 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERI3O43414 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERI3O43414 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERI3O43414 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERI3O43414 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERI3O43414 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERI3O43414 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms